作物殘體可做廄肥、堆肥或留在田間當有機肥，雖然作物殘體所含養分不高，但主要是可改善土壤的構造，及分解時產生許多有機酸，對土壤營養成分之有效性有增進的效果，尤其對微量元素之供應有其重要性。

　　堆肥是動植物體之廢棄物經堆置及部分分解的產物，由于質材來源種類甚多，甚至垃圾都可做堆肥，一些對制作堆肥的基本了解是必須的：

　　堆肥的施用目的是增進土壤有機質及生長促進劑，以便維持土壤地方， 尤其對土壤物理性、化學性及生物均甚有助益。

　　有機物的分解是靠微生物進行的，因此制造堆肥的環境要適合微生物活動的條件，例如有充分的濕度及通氣。在生產過程中需要經堆積及翻轉的步驟，也需要足夠的氮素提供微生物之繁殖。為了使堆積有更好的開始，可利用腐熟堆肥或微生物接種劑加速堆肥之形成分解時堆肥能產主高溫，有助殺死病菌，因此堆肥外覆蓋以增加溫度也是有用的方法。

　　添加礦物質及其他有機質可加速堆肥腐熟之功效，尤其是氮素類的有機質(豆類粉及酵母粉)的添加，對「碳氮比」高的堆肥質料最有效，常施用 0.l～1 % 之量。石灰質材可減少酸性發生，例如石灰石粉常見施用0.3-0.5% 量，有助堆肥之質量。

　　土壤動物也是常被考慮有加速有機質分解的效用，但實際應用較少。

　　殘質及堆肥應用范圍：

　　作物草桿殘質 （如稻草、玉米桿等）在播種前愈早施入或打入土壤愈好，可避免營養元素（如氮、微量元素等）被分解之微生物吸收固定，否則，幼苗將受殘質影響，引起缺乏營養及黃化。因此施用未腐熟之作物草桿殘質，需配合含氮較高的有機氮肥。

　　排水不良之田應減少大量施用作物殘質或未腐熟之堆肥，排水不良的土壤在嫌氣（缺氧氣）下，有機物易分解成有害物質，將引起作物根部之傷害。有病害及雜草結種子的草桿不宜直接施用，以免病原菌及雜草種子孳長，否則得不償失。